Este paraje también está catalogado como ZEPA (Zona de Especial Protección de Aves). El 8 de enero de 1998, fue propuesto como LIC (Lugar de Interés Comunitario) y ha sido ampliado hasta 12.238 ha. el 12 de febrero de 2004. Este espacio es colindante en su parte oriental con el LIC "Sabinares de la Sierra de Cabrejas".

La formación más espectacular es el propio Cañón fruto de la doble acción erosiva, de desgaste y, sobre todo, de disolución de la roca por el agua, siendo más vivo el hundimiento del lecho al ceder las grutas subterráneas, por lo que aparecen las típicas zonas cóncavas o lermas en los flancos del cañón, que además son muy vistosas por los teñidos de óxidos y aguas que escurren.

Por el hielo-deshielo se encuentran al pie del Cañón capas inclinadas de derrubios de elementos angulosos.

El resto del conjunto calizo se ha erosionado formando un Karst que en superficie muestra alguna torca, abundantes cuevas, simas y sumideros; mientras que en profundidad es un ejemplo de funcionamiento de acuífero y de aguas subterráneas.

Entre los árboles el pionero y emblemático es la sabina albar o enebro (Juniperusthurifera), conviviendo con el pino pudio(P¡nusnigra ssp.salzmanni), quejigo (Quercus faginea) y encina (Quercus ilex).

Entre los matorrales asociados destacan el enebro, gayuba y aliaga acompañados por especies aromáticas del páramo, espliego, tomillos y salvias. En los cortados existe una importante muestra de plantas a prote¬ger, que viven en roca como la Saxífraga cunéala, o en derrubios como Linaria supina. En las riberas, chopos y sauces y las grandes hojas flotantes de los nenúfares, lentejuelas y eneas.

El Cañón con sus paredes, repisas y oquedades es un singular refugio de aves, como el buitre común (Gyps fulvus) y otras rapaces protegidas como águilas: real, culebrera y calzada; halcón peregrino, azor, cernícalos y rapaces nocturnas como el buho real y chico, lechuza, cárabo, autillo y mochuelo. Otras aves especializadas son: garza real, del medio acuático; alondra co¬mún, del medio estepario; picogordo, del bosque; el alimoche y la chova piquirroja en los cantiles, etc...

Existe una importante representación de anfibios, reptiles y peces; como ranas, lagartijas, culebras, víbora hocicuda, trucha común y barbo.

Entre los mamíferos se encuentran corzo, jabalí, conejo, ardilla, liebre, zorro, garduña, comadreja, tejón, nutria y murciélagos.